تعمل شركة مياه الشرب والصرف الصحي في أسيوط والوادي الجديد على تفعيل دور إدارة الصرف الصناعي، التي تهدف إلى الحد من التلوث الناتج عن المنشآت الصناعية، والحفاظ على استثمارات الشركة في محطات رفع ومعالجة وشبكات المياه، وذلك من خلال إجراء عمليات رقابة ومتابعة وتحليل لمخرجات هذه المنشآت، والتأكد من مطابقتها للمواصفات والمعايير المحددة.