وفي عام 1974 حصل مصطفى الفقي على ماجستير الفلسفة في العلوم السياسية من كلية الدراسات الشرقية والأفريقية S.O.A.S ـ كما حصل على درجة الدكتوراه من جامعة لندن عام 1977.

التحق مصطفى الفقي بالسلك الدبوماسي فعمل في سفارتى مصر ببريطانيا والهند، كما تم انتخابه عضوا بمجلس الشعب كعضو في الحزب الوطني الديمقراطي سابقا، ثم عمل مستشاراً في رئاسة الجمهورية.

ساهم مصطفى الفقي في برامج التوك شو حيث كان له برنامج سنوات الفرص الضائعة على قناة النهار وهو برنامج متميز لا ينقصه التشويق لكونه يشهد على عصر مبارك.

وللدكتور مصطفى الفقي إسهامات كثيرة في مجال الكتابة لعل أبرزها كتاب تجديد الفكر القومي والصادر عن دار الشروق في القاهرة عام 1993 وحقق عدة طبعات جعلته يفوز بجائزة الدولة التشجيعية وجائزة أفضل كتاب من معرض القاهرة الدولي للكتاب في عام الإصدار.

وحصل الدكتور مصطفى الفقي على جوائز كثيرة منها كأس الخطابة في أسبوع شباب الجامعات المصرية عام 1965، كما حصل على الجائزة الأولى في المقال السياسى للشباب من المجلس الأعلى للعلوم والفنون والآداب سنة 1966.

وحصل الدكتور مصطفى الفقي على جائزة أفضل كتاب في الفكر السياسى من معرض القاهرة الدولي للكتاب،كما نال جائزة الدولة التشجيعية عام 1994 م، ونال وسام العلوم والفنون من الطبقة الأولى من حكومة النمسا عام 1998 م.

ونجح الدكتور مصطفى الفقي في الحصول على أعلى وسام نمساوى يعطى للسفراء الاجانب، كما حصل على جائزة الولة التقديرية في العلوم الاجتماعية 2003 ـ وجائزة "النيل العليا" 2010